Replace monthly GMI bar chart with daily scatter + rolling avg + linear trend/CI

Adds daily_gmi() and gmi_trend(): per-day GMI as scatter points, a 7-day
rolling average line, and a linear regression trend line with a 95%
confidence band (normal approximation, no scipy dependency, consistent
with the existing preference for a lean container image).

Recomputed from the already-fetched period data on each page load; the
existing 1-hour Streamlit cache on load_range_data() already avoids
repeated Nightscout calls for the same period, so no separate storage
layer is needed at the current max. 90-day report window.

Closes gitea #19.
This commit is contained in:
2026-08-01 22:57:54 +02:00
parent 9e11dd8d73
commit 374ead70e5
3 changed files with 173 additions and 11 deletions
+63
View File
@@ -11,6 +11,7 @@ from __future__ import annotations
from itertools import pairwise
import numpy as np
import pandas as pd
from nightscout_client import INSULIN_EVENT_TYPES
@@ -35,6 +36,68 @@ def gmi_percent(mean_mmol: float) -> float:
return round(3.31 + 0.4311 * mean_mmol, 1)
GMI_TREND_COLUMNS = ["date", "gmi", "rolling_avg", "trend", "trend_lower", "trend_upper"]
def daily_gmi(glucose: pd.DataFrame) -> pd.DataFrame:
"""Geschat HbA1c (GMI) per kalenderdag — scatterpunten voor de trendgrafiek (gitea #19)."""
if glucose.empty:
return pd.DataFrame(columns=["date", "gmi"])
df = glucose.copy()
df["date"] = df["timestamp"].dt.date
daily_mean = df.groupby("date")["mmol"].mean()
result = daily_mean.apply(gmi_percent).reset_index()
result.columns = ["date", "gmi"]
return result.sort_values("date").reset_index(drop=True)
def gmi_trend(glucose: pd.DataFrame, rolling_window_days: int = 7) -> pd.DataFrame:
"""Dagelijkse GMI-punten plus voortschrijdend gemiddelde en een lineaire
trendlijn met 95%-betrouwbaarheidsband (gitea #19).
Gebruikt een normaalbenadering (z=1.96) voor de betrouwbaarheidsband i.p.v.
een exacte t-verdeling — dat zou een scipy-dependency toevoegen aan een
verder bewust lichte container (dezelfde afweging als het niet gebruiken
van kaleido in pdf_export.py). Bij de hier gebruikelijke steekproefgroottes
(14-90 dagpunten) is het verschil met de exacte t-kritieke waarde
verwaarloosbaar voor een visuele trendindicatie.
Elke keer opnieuw berekend uit de al-opgehaalde periode-data (geen aparte
database) — de bestaande 1-uurs Streamlit-cache op load_range_data()
voorkomt al herhaalde Nightscout-calls voor dezelfde periode. Bij een
veel langere trend (jaren i.p.v. de huidige max. 90 dagen) zou een aparte
opslag wél de moeite waard worden.
"""
daily = daily_gmi(glucose)
if len(daily) < 2:
return daily.reindex(columns=GMI_TREND_COLUMNS)
daily = daily.copy()
daily["rolling_avg"] = daily["gmi"].rolling(window=rolling_window_days, min_periods=1).mean()
x = np.arange(len(daily), dtype=float)
y = daily["gmi"].to_numpy()
slope, intercept = np.polyfit(x, y, 1)
fitted = intercept + slope * x
residuals = y - fitted
degrees_of_freedom = max(len(x) - 2, 1)
residual_std = np.sqrt(np.sum(residuals**2) / degrees_of_freedom)
x_mean = x.mean()
sum_sq_x = np.sum((x - x_mean) ** 2)
standard_error = (
np.zeros_like(x)
if sum_sq_x == 0
else residual_std * np.sqrt(1 / len(x) + (x - x_mean) ** 2 / sum_sq_x)
)
z_95 = 1.96
daily["trend"] = fitted
daily["trend_lower"] = fitted - z_95 * standard_error
daily["trend_upper"] = fitted + z_95 * standard_error
return daily[GMI_TREND_COLUMNS]
def percent_cv(glucose: pd.DataFrame) -> float:
"""Glucosevariabiliteit als %CV (standaarddeviatie / gemiddelde * 100)."""
if glucose.empty: